В периода 2005-2009 Ливърпул бе истинско страшилище в Европа. Тактиката на Рафа бе много подходяща да турнирните битки и "червените" спечелиха трофея през 2005-а, а през 2007-а играха финал. След това отборът достигна до полуфиналите и до четвъртфиналите. В последните си сезон изведе Ливърпул до полуфиналите в Лига Европа.
Общо 4 бяха купите, спечелени по времето на Рафа на "Анфийлд". Под негово ръководство Ливърпул спечели още ФА къп, Суперкупата на Европа и трофея Комюнити шийлд. Рафа бе близо до това да вдигне и Купата на Лигата, но в първия си сезон на "Анфийлд" загуби финала срещу Челси. Мърсисайдци играха и финал на световното клубно първенство, който загубиха нещастно от бразилския Сао Пауло.
Когато Жилет и Хикс купиха отбора, те не бяха приети добре, а Бенитес застана на страната на запалянковците. Искаха да го уволнят, но Рафа не се предаде.
През 2011-а бе уловен да плаче на трибуните по време на 22-та годишнина от трагедията на "Хилсбъро". Рафа опозна феновете и опозна и големите им болки. След напускането си, дари 96 хил. паунда за семействата на загиналите.
През пролетта на 2009-а Ливърпул бе много близо до титлата, а една седмица през март остава незабравима. Реал Мадрид бе победен с 4:0 на "Анфийлд", а няколко дни по-късно бе повален Юнайтед с 4:1 на "Олд Трафорд". После дойде ред на Астън Вила - 5:0 с хеттрик на Джерард.
Имаше и несполуки, но Рафа привлече Шаби Алонсо, Пепе Рейна, Даниел Агер, Алваро Арбелоа, Хавиер Машчерано, Дирк Каут, Фернандо Торес... Но най-големият му принос бе, че тези играчи станаха още по-добри от момента, в който стъпиха на "Анфийлд".
Това вероятно е най-великият мач в новата футболна история. Всички знаем какво се случи и как Ливърпул вдигна титлата от Шампионската лига в Истанбул, след като на полувремето губеше с 0:3 от Милан.